【佳學(xué)基因檢測(cè)】基因數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行了再次更新，收集基因序列數(shù)據(jù)超過(guò)31億 

GenBank 252.0版（2022年10月17日）現(xiàn)已在NCBI FTP網(wǎng)站上發(fā)布。這個(gè)版本有20.35萬(wàn)億個(gè)堿基和31億個(gè)記錄。新發(fā)布的版本有240539282條傳統(tǒng)記錄，其中包含1562963366851個(gè)堿基對(duì)的序列數(shù)據(jù)。還有2167900306條WGS記錄，包含1823196008828個(gè)堿基對(duì)的序列數(shù)據(jù)，57402800條批量定向TSA記錄，包含511476787957個(gè)堿基，115123306條批量定向TLS記錄，包括43860512749個(gè)堿基。

發(fā)布之間的增長(zhǎng)

在GenBank發(fā)布251.0和252.0的截止日期之間的63天內(nèi)，GenBank的傳統(tǒng)部分增加了70162662354個(gè)堿基對(duì)和623496個(gè)序列記錄。在同一期間，更新了25466項(xiàng)記錄。平均每天增加和/或更新10301條傳統(tǒng)記錄。

在版本251.0和252.0之間，GenBank的WGS部分增加了720151132199個(gè)堿基對(duì)和143800629個(gè)序列記錄。GenBank的TSA成分增加了13975407571個(gè)堿基對(duì)和13823250個(gè)序列記錄。GenBank的TLS成分增加了8232104個(gè)堿基對(duì)和19779個(gè)序列記錄。

此版本的序列數(shù)據(jù)文件總數(shù)增加了216個(gè)。劃分如下：

BCT：37個(gè)新文件，現(xiàn)在總共857個(gè)

CON:刪除了28個(gè)文件，現(xiàn)在總共231個(gè)

ENV：3個(gè)新文件，現(xiàn)在總共75個(gè)

INV:99個(gè)新文件，現(xiàn)在總共965個(gè)

PLN:61個(gè)新文件，現(xiàn)在總共1013個(gè)

VRL:39個(gè)新文件，現(xiàn)在總共813個(gè)

VRT:5個(gè)新文件，現(xiàn)在總共320個(gè)

序列數(shù)據(jù)文件注釋

隨著2022年4月GenBank發(fā)布249.0版本，我們注意到CON部門(mén)的36個(gè)序列平面文件數(shù)量異常大。增加的原因是將“外部注釋”錯(cuò)誤地納入了ASN。一組CON記錄中的174個(gè)WGS相關(guān)軟骨支架的1個(gè)版本。

GenBank平面文件表示中這174條記錄的呈現(xiàn)和內(nèi)容沒(méi)有受到此錯(cuò)誤的負(fù)面影響。但是，使用ASN的客戶(hù)。1表示GenBank記錄時(shí)，其大小會(huì)急劇增加。

在2022年10月的GenBank版本252.0中糾正了這個(gè)問(wèn)題，CON部門(mén)文件的總數(shù)減少了。對(duì)于由此造成的任何困難，深表歉意。

其他信息

出于下載目的，請(qǐng)記住，未壓縮的GenBank版本252.0序列數(shù)據(jù)平面文件大約需要2815 GB。ASN.1數(shù)據(jù)文件大約需要1432 GB。

有關(guān)GenBank 252.0版的更多信息，請(qǐng)參閱發(fā)行說(shuō)明以及GenBank和ASN中的README文件。FTP上的ASN.1 (ncbi-asn1) 目錄。