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【佳學基因檢測】基因解碼抓住多組學數據分析的關鍵節(jié)點、關鍵問題

基因解碼是佳學基因的大數據分析,基因解碼分析使用的基本培訓數據是由國外科研專家團隊基于近20年收集的knowledge base,可以更加簡單、快速、正確地挖掘細胞亞群背后的分子機理和生物學功能。基因解碼還整合OmicSoft中來自TCGA、GEO、ArrayExpress、ICGC、BLUEPRINT等國際項目的數據,基因解碼中新增加的結構功能活性關系圖可以快速查看單個分子、網絡、通路、功能等在>60,000多個分

佳學基因檢測】基因解碼抓住多組學數據分析的關鍵節(jié)點、關鍵問題

 
NO.1在高通量數據挖掘的過程中,是否有以下的問題一直困擾著您?

1.找到了幾百甚至上千的顯著差異基因/蛋白,但不知如何從中挖掘有用的信息…

2.做了 KEGG 的 pathway富集分析,但差異基因/蛋白分散在幾十個 pathway 中,也很難看出相互之間有什么關聯…

3.做了GO分類,但仍然無法解釋這些差異基因/蛋白是如何與這些生物功能相關的…

4.通過蛋白-蛋白相互作用數據庫,得到了雜亂如麻的相互作用圖,不知如何將這些相互作用關系與研究的問題關聯起來…

5.擔心數據的假陰性和假陽性可能會對后續(xù)生物學意義的深度挖掘造成較大的影響,但又不知道如何規(guī)避這些偏差…
 

基因解碼可以通過對敲減、過表達、或者藥物處理等獲得的差異基因一次進行多個分析,其中包括了經典通絡分析,功能與疾病分析,上游調控因子分析,調控效應分析,分析網絡分析。

 

NO.2 如今高質量的組學研究項目或文章,除了需要深度挖掘自己的數據之外,同時需要利用好海量的公共數據。在您的研究中是否經常遇到這樣的困擾?
 

1.發(fā)現的關鍵分子、藥物在哪些公共的組學項目中顯著激活或抑制?

2.發(fā)現的關鍵信號通路或代謝通路、生物學功能在哪種類型的公共的組學項目中顯著激活或抑制?

3.這些關鍵分子、通路和功能富集到的項目有哪些共同特征?

4.發(fā)現的關鍵分子在公共數據集中的表達、突變、臨床相關性等特征怎樣?

基因解碼可以幫你解決這些問題

基因解碼是佳學基因的大數據分析,基因解碼分析使用的基本培訓數據是由國外科研專家團隊基于近20年收集的knowledge base,可以更加簡單、快速、正確地挖掘細胞亞群背后的分子機理和生物學功能?;蚪獯a還整合OmicSoft中來自TCGA、GEO、ArrayExpress、ICGC、BLUEPRINT等國際項目的數據,基因解碼中新增加的結構功能活性關系圖可以快速查看單個分子、網絡、通路、功能等在>60,000多個分析項目中的活性變化。同時,這60,000多個項目包含了詳細的疾病類型、用藥信息、處理方法、組織來源等生物學和臨床信息,可以挖掘具有統計學意義的生物學或臨床特征。

眾所周知人類疾病表征的基因信息本質解釋是一門工具學科,任何一門學科都是需要大量的時間去學習理解方能靈活運用。但是如果能把所需的多維信息數據都整合到一個分析系統當中從而只需稍加學習就能獲取同樣質量甚至更好的結果呢?基因解碼做到了這一點呢?

 
(責任編輯:佳學基因)
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