【佳學(xué)基因檢測】基因解碼基因檢測揭示正常細胞抑制腫瘤的原因

腫瘤的基因檢測的位點從正常細胞的研究中獲得數(shù)據(jù)：

《腫瘤發(fā)生的分子物學(xué)基礎(chǔ)》清楚地闡述了MicroRNA（miRNA）在各種類型的癌癥中的表達調(diào)控異常。將其納入腫瘤基因正確用藥850中，在幅度提高腫瘤致病基因及靶向藥物發(fā)現(xiàn)的正確性。而且基于對MicroRNA的作用的基因解碼結(jié)果，另一種特殊的靶向藥物：反義寡核苷酸藥物被巧妙地設(shè)計出來，并被用于阻斷導(dǎo)致腫瘤發(fā)生的腫瘤miR。但作為一種有效的抗癌策略，腫瘤抑制性miRNA的遞送具有巨大的潛力。《正常組織中的miRNA生理功能的基因解碼》的目的在于對于在各種類型的腫瘤中低表達但在多種正常組織中大量表達的miRNA的鑒定及功能分析。
 

如何分析正常組織和異常腫瘤組織中的miRNA的作用

從TCGA大數(shù)據(jù)中心選擇獲取14種癌癥類型的miRNA高通量、下一代測序（NGS)數(shù)據(jù)。使用limma軟件包（R編程）計算腫瘤和正常樣本之間miRNA表達的顯著差異。調(diào)整后的p值<0.05用于比較正常和腫瘤miRNA表達譜。使用TargetScan、miRanda和miRDB獲得預(yù)測的基因靶點，然后使用Enrichr進行基因本體分析。只有調(diào)整后p<0.05的GO術(shù)語被認為具有統(tǒng)計學(xué)意義。數(shù)據(jù)分析后所得的數(shù)據(jù)再通過細胞活力測定和流式細胞術(shù)等真實實驗室數(shù)據(jù)的所有數(shù)據(jù)均以平均值±SEM表示，并使用GraphPad Prism軟件分析其差異（Student’s t檢驗，p<0.05）。

從miRNA基因解碼中如何增加了可信賴的基因檢測位點

通過匯編來自癌癥基因組圖譜（TCGA）泛癌癥項目的所有公開可用的miRNA圖譜數(shù)據(jù)，《腫瘤發(fā)生的分子物學(xué)基礎(chǔ)》發(fā)現(xiàn)了一小組腫瘤抑制miRNA（基因解碼稱之為“正常組分”），它們在14種正常組織中高度表達，但在相應(yīng)的腫瘤組織中低表達。有趣的是，肌肉組織中富有的miRNA（例如miR-133a/b和miR-206）和來自DLK1-DIO3位點的miRNA（例如miR-381和miR-411）構(gòu)成了正常組分的很大一部分。此外，《正常組織中的miRNA生理功能的基因解碼》明確了定義了CCCGU基序特異性基因序列在腫瘤miR的種子序列中缺失，但在一部分腫瘤抑制性miRNA中存在。賊后，候選正常組分在幾種癌細胞類型中的功能獲得表明，miR-206和miR-381在體外對多種癌細胞類型發(fā)揮賊有效的抑制作用。這些基因位點的突變成為佳學(xué)基因解碼高度推薦的腫瘤致病基因位點。它們到目前為止嘗未進入大多數(shù)腫瘤致病基因鑒定基因檢測及腫瘤用藥指導(dǎo)基因檢測中。

《正常組織中的miRNA生理功能的基因解碼》研究結(jié)論：

發(fā)現(xiàn)了這是一組抑制腫瘤的miRNA，強調(diào)了它們具有針對多種腫瘤的miRNA替代療法的潛力。這些基因序列可以用來進行腫瘤基因檢測，從而增加腫瘤發(fā)病原因的基因檢測及腫瘤正確用藥基因檢測的正確性。