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【佳學(xué)基因檢測(cè)】并指癥基因檢測(cè)應(yīng)該怎么做?如何避免假陰性結(jié)果?

并指畸形(syndactyly)是一種手足畸形,其特征是兩個(gè)或多個(gè)手指或腳趾未完全分開(kāi)。此病癥可分為綜合征性和非綜合征性?xún)纱箢?lèi),其中涉及的基因和位點(diǎn)眾多。科學(xué)研究已識(shí)別出多個(gè)與并指畸

佳學(xué)基因檢測(cè)】并指癥基因檢測(cè)應(yīng)該怎么做?如何避免假陰性結(jié)果?



并指基因檢測(cè)的位點(diǎn)

并指畸形(syndactyly)是一種手足畸形,其特征是兩個(gè)或多個(gè)手指或腳趾未完全分開(kāi)。此病癥可分為綜合征性和非綜合征性?xún)纱箢?lèi),其中涉及的基因和位點(diǎn)眾多??茖W(xué)研究已識(shí)別出多個(gè)與并指畸形相關(guān)的關(guān)鍵基因,這些基因位點(diǎn)對(duì)于診斷和篩查具有重要意義。

  1. GJA1基因:該基因編碼連接蛋白(connexin 43),主要參與細(xì)胞間的電信號(hào)傳遞。GJA1突變與非綜合征性并指畸形相關(guān),并可能影響手指和腳趾的分化過(guò)程。

  2. HOXD13基因:HOXD13基因在胚胎發(fā)育中扮演重要角色,尤其在四指和腳趾的發(fā)育過(guò)程中。HOXD13突變與非綜合征性并指畸形有關(guān),它可能通過(guò)調(diào)節(jié)皮膚和骨質(zhì)發(fā)育的途徑來(lái)影響并指畸形的發(fā)生。

  3. FGF16基因:纖維母細(xì)胞生長(zhǎng)因子16(FGF16)與胚胎發(fā)育中的組織模式形成有關(guān),它的突變可能導(dǎo)致手指或腳趾的分化異常。

  4. LMBR1基因:LMBR1基因與綜合征性和非綜合征性并指畸形都有關(guān)。該基因在胚胎發(fā)育中調(diào)控四指網(wǎng)的形成,其突變可能影響四指的正常發(fā)育。

  5. LRP4基因:LRP4基因在與WNT信號(hào)傳導(dǎo)相關(guān)的發(fā)育通路中發(fā)揮作用,其突變與Cenani-Lenz綜合征相關(guān),也可能影響并指的發(fā)生。

  6. HOX13基因:HOX13基因也是與并指畸形相關(guān)的重要基因,尤其在綜合征形式的并指中扮演重要角色。

這些基因及其位點(diǎn)的識(shí)別有助于提供精準(zhǔn)的診斷和篩查方法,尤其是在產(chǎn)前診斷中,當(dāng)傳統(tǒng)的放射診斷方法難以實(shí)施時(shí),基因檢測(cè)提供了一個(gè)有效的替代方案。

并指基因檢測(cè)的科學(xué)性

并指基因檢測(cè)的科學(xué)性體現(xiàn)在幾個(gè)方面:

  1. 遺傳異質(zhì)性:并指畸形的遺傳基礎(chǔ)非常復(fù)雜,不同基因的突變可以導(dǎo)致類(lèi)似的表型。例如,LRP4基因突變與Cenani-Lenz綜合征相關(guān),但其他基因如APC也能導(dǎo)致類(lèi)似的表型。這表明并指畸形的遺傳機(jī)制可能涉及多個(gè)基因和信號(hào)通路。

  2. 非編碼區(qū)域和內(nèi)含子變異:基因檢測(cè)不僅關(guān)注外顯子中的突變,還需要考慮內(nèi)含子和非編碼區(qū)域中的變異,這些區(qū)域可能也會(huì)對(duì)基因功能產(chǎn)生影響。例如,表觀遺傳學(xué)的變異和非編碼RNA可能會(huì)影響基因表達(dá),進(jìn)而影響并指的發(fā)生。

  3. 多路徑通路的參與:并指畸形的發(fā)生不僅涉及WNT、Notch和ADAMTS信號(hào)通路,還可能涉及其他尚未明確的通路。因此,基因檢測(cè)不僅要關(guān)注已知的關(guān)鍵基因,還應(yīng)考慮這些基因之間的相互作用。

  4. 表型異質(zhì)性:并指畸形的表型異質(zhì)性意味著同一基因的突變可能在不同個(gè)體中表現(xiàn)出不同的癥狀或嚴(yán)重程度。這要求基因檢測(cè)不僅要識(shí)別出突變,還需要結(jié)合具體的臨床表現(xiàn)來(lái)解讀結(jié)果。

并指基因檢測(cè)的意義

并指基因檢測(cè)具有重要的臨床和研究意義:

  1. 早期診斷和干預(yù):通過(guò)基因檢測(cè)可以在產(chǎn)前或出生后早期診斷并指畸形,從而采取早期干預(yù)措施。這對(duì)于減少并指畸形對(duì)患者生活質(zhì)量的影響具有重要意義。

  2. 個(gè)體化治療:基因檢測(cè)提供的詳細(xì)遺傳信息有助于制定個(gè)體化的治療方案。例如,對(duì)于不同基因突變導(dǎo)致的并指畸形,可以根據(jù)具體的突變類(lèi)型選擇最適合的干預(yù)措施。

  3. 篩查和預(yù)防:在產(chǎn)前篩查中應(yīng)用基因檢測(cè),可以識(shí)別出高風(fēng)險(xiǎn)的胎兒,從而提供針對(duì)性的監(jiān)測(cè)和干預(yù)。特別是在高風(fēng)險(xiǎn)家庭中,基因檢測(cè)可以幫助識(shí)別潛在的遺傳風(fēng)險(xiǎn)

  4. 研究和新治療的開(kāi)發(fā):基因檢測(cè)不僅幫助理解并指畸形的遺傳機(jī)制,還有助于開(kāi)發(fā)新的治療方法和生物標(biāo)志物。例如,通過(guò)研究涉及并指畸形的基因和通路,可以發(fā)現(xiàn)新的治療靶點(diǎn)。

  5. 綜合征的分類(lèi):在一些綜合征中,并指畸形可能是分類(lèi)的重要依據(jù)。例如,在Smith-Lemli-Opitz綜合征(SLOS)中,第二和第三腳趾的并指可以作為診斷的關(guān)鍵特征。

總的來(lái)說(shuō),并指基因檢測(cè)的位點(diǎn)和科學(xué)性對(duì)于理解和管理并指畸形具有重要的臨床和研究?jī)r(jià)值。通過(guò)進(jìn)一步的研究和技術(shù)進(jìn)步,我們可以期待基因檢測(cè)在并指畸形的早期診斷、個(gè)體化治療和疾病預(yù)防方面發(fā)揮更大的作用。


綜合征性并指遺傳決定因素

根據(jù)《人體手指異常的基因原因》,發(fā)生在人身上的并指畸形有 300 多種綜合征形式,因此其分類(lèi)復(fù)雜,需要借助基因檢測(cè)進(jìn)行明確。并指癥基因檢測(cè)的大數(shù)據(jù)分析收錄了按照發(fā)病機(jī)制進(jìn)行分類(lèi)的部分并指綜合征的臨床表征,將其列于表1。

基因 綜合征類(lèi)型 OMIM 常見(jiàn)變異 遺傳方式 臨床表現(xiàn) 如何到致疾病的發(fā)生
1 (a) 編碼區(qū)域中的遺傳決定因素
 ROR2 短指癥 B 型(BDB1) 113000 c.1324C.T; p.R441X AD 短指癥的特征是遠(yuǎn)端指骨發(fā)育不全/發(fā)育不全,伴有遠(yuǎn)端指骨聯(lián)合畸形、腕骨/跗骨融合和部分皮膚并指畸形 促進(jìn) WNT 過(guò)度表達(dá)
 SOST 硬化性骨化病 269500 無(wú)義突變 AR 很多病例存在食指和中指皮膚不對(duì)稱(chēng)并指畸形。下頜呈異常方形  
 LRP4 硬化性骨化病,2 614305 c.3508C > T; p.R1170W and c.3557G > C; p.W1186S AD, AR 漸進(jìn)性骨骼過(guò)度生長(zhǎng)。并指畸形是一種可變的表現(xiàn)  
 GLI3 Pallister–Hall 綜合征 146510 單倍體不足,c.1468_1469insG 和 c.1007_1008dupAC AD 下丘腦錯(cuò)構(gòu)瘤、垂體功能障礙、中樞性多指畸形和不同程度的并指畸形 BMP 抑制
  格雷格頭顱多指并指綜合征 175700 c.2374C > T; p.Arg792* AD 與軸前和軸后多指畸形和可變并指畸形相關(guān)的額葉隆起、舟狀頭畸形和眼距過(guò)寬  
 LMBR1 三指節(jié)拇指-多指并指綜合征 174500 ZRS 增強(qiáng)子上的 287 位 AD 這種畸形的拇指通常是對(duì)生的,并具有正常的掌骨。并指畸形的程度各不相同  
 DHCR7 Smith-Lemli-Opitz 綜合征 270400 c.453G > A; p.W151X AR 影響多個(gè)身體系統(tǒng),其中 2 和 3 趾并指畸形是常見(jiàn)癥狀  
 RAB23 卡彭特綜合征 201000 純合無(wú)義/移碼致病變異 c.434 T > A; p.L145X AR 顱縫早閉、多指并指、肥胖和心臟缺陷  
 FGFR2 Apert 綜合征 101200 c.755C > G; p.S252W or c.758C > G; p.P253W AD 顱縫早閉、中面部發(fā)育不全、手足并指畸形,且有骨結(jié)構(gòu)融合的趨勢(shì) FGF過(guò)度表達(dá)
 FGFR1/FGFR2 菲弗綜合征 101600 FGFR1 – p.P252R AD 1 型為經(jīng)典綜合征,與生活相容,包括顱縫早閉、中面部缺陷、拇指寬、大腳趾寬、短指畸形和可變性并指畸形  
 TWIST1;FGFR3 Saethre–Chotzen 綜合征 101400 FGFR3 p.P250R, deletion of TWIST1 AD 顱縫早閉、面部畸形、手足畸形。并指畸形的程度也各不相同  
 HOXD13 短指并指綜合征 610713 多聚丙氨酸收縮,c.950A > G;p.Q317K n.r 短指畸形和并指畸形(部分皮膚織帶)與少指畸形相關(guān) 視黃酸抑制
 LRP4 硬化性骨化病2型 614305 c.1151A > G; p.Tyr384Cys AD, AR 漸進(jìn)性骨骼過(guò)度生長(zhǎng)。并指畸形是一種可變的表現(xiàn) Notch 信號(hào)的抑制


其他基因位點(diǎn)/基因突變序列

臨床表現(xiàn) 如何到致疾病的發(fā)生
1 (b) 非編碼區(qū)域中的遺傳決定因素
 內(nèi)含子 EMID2 全前腦畸形譜系障礙和嚴(yán)重上肢并指畸形 異位SHH表達(dá)
 內(nèi)含子 5 LMBR1 無(wú)多指畸形的皮膚并指畸形 ICD 減少
 內(nèi)含子IRF6 范德沃德綜合征(MIM:119,300) 未分類(lèi)
22 個(gè)內(nèi)含子YY1AP1 的外顯子化 Grange 綜合征(MIM:602,531)伴有有效性皮膚并指畸形。手指:右手第三、第四、第五根手指和第三/第四根手指。腳趾:第二/第三根腳趾雙側(cè)皮膚并指畸形 未分類(lèi)
 內(nèi)含子 6 KATNB1 先天性小頭畸形、無(wú)腦畸形、身材矮小、多指畸形和牙齒異常 未分類(lèi)
 內(nèi)含子 8 FGFR2 Apert 綜合征(MIM 101,200) 未分類(lèi)
 IVS8-1G > C 基因突變序列DHCR7 Smith-Lemli-Opitz 綜合征(MIM 270,400) BMP 抑制
 前 ZRS 區(qū)域 TPS(MIM:174,500) 異位表達(dá)

AR常染色體隱性遺傳,AD常染色體顯性遺傳,XLR X 連鎖隱性遺傳,nr由于證據(jù)不足未報(bào)告,EMID2 EMI 結(jié)構(gòu)域含 2,LMBR1肢體發(fā)育膜蛋白 1,IRF6干擾素調(diào)節(jié)因子 6,YY1AP1 YY1 相關(guān)蛋白 1,KATNB1 Katanin,p80 亞基 B1,F(xiàn)GFR2成纖維細(xì)胞生長(zhǎng)因子受體 2,TPS拇指多指并指綜合征

編碼區(qū)域的變異

下面列出了一些綜合征及其在典型發(fā)病機(jī)制中每個(gè)相互作用的記錄,但必須注意的是,還存在許多其他綜合征。每種綜合征的遺傳變異列于表?格1。

觀察到的一些主要 WNT 過(guò)度表達(dá)綜合征包括 B 型短指癥 (BDB1) (MIM 113000)、硬化性骨化病 (MIM 269500) 和硬化性骨化病 2 (MIM 614305)。

BDB1 被定位到ROR2基因 (9q22.31),該基因編碼 WNT 配體(如 WNT5a)的輔助受體。由于已發(fā)現(xiàn) ROR2 的 CRD 與 Frizzled 受體的 WNT 結(jié)合域驚人地相似,因此推測(cè) ROR2 可能與經(jīng)典的 WNT 信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)有關(guān)。它也被認(rèn)為參與了非經(jīng)典的 WNT-PCP 相互作用,因?yàn)榕c WNT5a 突變小鼠相比,具有突變 ROR2 的小鼠產(chǎn)生相似的表型。硬化性骨化病 2 已被定位到LRP4基因,其中硬化素和 LRP4 之間存在直接相互作用,并且 LRP4 促進(jìn)硬化素介導(dǎo)的 WNT 抑制;這與LRP4突基因突變序列有關(guān)。此外,已知 LRP4 與 Notch 通路的相互作用在進(jìn)化上是保守的,并且LRP4基因中高度保守的 EGF-2 鈣結(jié)合結(jié)構(gòu)域中的純合錯(cuò)義基因突變序列也被推測(cè)可以消除 Notch 信號(hào)傳導(dǎo)。

賊后,在骨硬化癥中,功能喪失的SOST基因變異可能使硬化素抑制 LRP5/6 和卷曲受體復(fù)合物,從而導(dǎo)致 β-catenin 磷酸化和下調(diào),從而抑制 WNT 信號(hào)相互作用。

被認(rèn)為促進(jìn) BMP 抑制的主要綜合征包括 Pallister-Hall 綜合征 (PHS) (MIM 146510) 和 Greig 頭顱多指并指綜合征 (MIM 175700)、三指節(jié)拇指多指并指綜合征 (TPS) (MIM 174500)、Smith-Lemli-Opitz 綜合征 (SLOS) (MIM 270400) 和 Carpenter 綜合征 (MIM 201000)。PHS 和 GCPS 均與GLI3基因相關(guān)。然而,Pallister-Hall 綜合征與中樞性多指有關(guān),而 GCPS 涉及前軸和后軸性多指。GLI3基因(7p14) 編碼一種轉(zhuǎn)錄因子,該轉(zhuǎn)錄因子是 SHH 信號(hào)的雙功能下游調(diào)節(jié)劑;與這兩種綜合征都有關(guān)。大多數(shù)GLI3基因變異與GLI3基因單倍體不足有關(guān),賊終導(dǎo)致 GLI3 激活劑 (GLIA) 或阻遏物 (GLIR) 形成的偏差。TPS 的常見(jiàn)遺傳決定因素包括跨越LMBR1基因的重復(fù)和RAB23基因(6p12.1-q12),該基因編碼音猬因子 (SHH )信號(hào)的負(fù)調(diào)節(jié)劑,在 Carpenters 綜合征中受到干擾。對(duì)于 SLOS,已知編碼酶 7-脫氫膽固醇 (7-DHC) 還原酶 ( DHCR7 : 11q13.4) 的基因被失調(diào)。據(jù)推測(cè), DHCR7基因協(xié)調(diào)膽固醇部分和 SHH 信號(hào)傳導(dǎo),從而控制并指表型的嚴(yán)重程度。

已證實(shí)可促進(jìn) FGF8 過(guò)度表達(dá)的綜合征性指癥主要包括 Apert 綜合征 (MIM 101200)、Pfeiffer 綜合征 (MIM 101600) 和 Saethre-Chotzen 綜合征 (MIM 101400)。FGFR2 基因變異表明該受體在 Apert 綜合征和 Pfeiffer 綜合征中均發(fā)揮作用。P253W 突基因突變序列可能會(huì)擾亂對(duì) FGF10 的配體結(jié)合特異性,導(dǎo)致外胚層中的 FGF10-FGF8 環(huán)過(guò)度刺激 FGF8。對(duì)于 Saethre-Chotzen 綜合征,TWIST1和FGFR1/3基因已被定位到該綜合征。TWIST1被歸類(lèi)為 FGF 的上游調(diào)節(jié)劑,因此調(diào)節(jié) FGF 表達(dá)。

賊后,短指-并指綜合征 (MIM 610713) 與HOXD13基因變異 (多聚丙氨酸收縮和錯(cuò)義變異) 有關(guān)。據(jù)推測(cè),HOXD13突基因突變序列會(huì)??抑制ECM 中的視黃酸 (RA)。

非編碼區(qū)域的變異

篩查該基因及其側(cè)翼區(qū)域的重要性仍然至關(guān)重要,因?yàn)榉蔷幋a區(qū)域中的替代剪接基因突變序列可能導(dǎo)致外顯子跳躍和表觀遺傳影響,從而導(dǎo)致蛋白質(zhì)畸形。修飾基因的存在被認(rèn)為會(huì)影響p63 和RAB23 基因基因突變序列的表型,這可能是造成家族內(nèi)變異的原因。許多內(nèi)含子位點(diǎn)(表?(表格1),1目前,已有 150 多個(gè)異常信號(hào)通路在并指表型中被發(fā)現(xiàn),但大多數(shù)異常信號(hào)通路需要對(duì)其進(jìn)行分類(lèi)。

 

非綜合征性并指遺傳決定因素

根據(jù)表型多樣性,非綜合征性并指畸形可分為 9 種類(lèi)型(I-IX)(表?(表2),2), 以及相應(yīng)的基因/位點(diǎn)。已發(fā)現(xiàn)的一些基因包括HOXD13、FBLN1、GJA1、LMBR1、LRP4、GREM1(BMP 拮抗劑)、FGF16以及賊近發(fā)現(xiàn)的BHLHA9。

表 2:與非綜合征性并指畸形相關(guān)的假定發(fā)病機(jī)制的基因/位點(diǎn)

非綜合征性并指畸形的類(lèi)型

基因座/基因 OMIM 常見(jiàn)基因突變序列 遺傳方式 臨床表現(xiàn) 發(fā)病原因
I-a ZD1;對(duì)指畸形;Weidenreich 型 3p21.31 609815 n.r AD 雙側(cè)、對(duì)稱(chēng)、 n.r
手指:正常
腳趾:僅 2/3
I-b SD1; Lueken型 2q34-q36 185900 n.r AD 通常,雙側(cè) n.r
手指:3/4 手指,皮膚/骨質(zhì)
腳趾:2/3 腳趾,皮膚
I-c 蒙塔古型 2q31-q32 n.r c.917G > A; p.R306Q, AD 通常情況下,雙邊 抑制視黃酸
HOXD13 c.916C > G; p.R306G 手指:僅限 3/4 手指,皮膚/骨骼
    腳趾:正常
I-d 卡斯蒂利亞型 n.r n.r n.r AD 雙邊 n.r
手指:正常
腳趾:4/5 僅腳趾,皮膚
II-a SPD1;沃爾丁堡型 2q31; 186000 Polyalanine repeat expansions, frameshift deletions, 2q31.1 microdeletion and G11A missense AD 手指:SPD,中軸(3/4 手指) 抑制視黃酸
HOXD13 腳趾:SPD,軸后(4/5 個(gè)腳趾)
II-b SPD2;德比爾型 22q13.3; 608180 t(12;22) (p11.2;q13.3) AD 手指:SPD 位于中心和軸后 FGFR8 表達(dá)增加
FBLN1 腳趾:軸后并指畸形
II-c SPD3; Malik type 14q11.2-q13 610,234 n.r AD 手指:SPD是核心 n.r
腳趾:SPD 后軸
III SDTY3;Johnston-Kirby型 6q21-q23; 186100 nt427G > A and AD 手指:4/5 根手指有效雙側(cè)并指;第五根手指短小,中指缺失或發(fā)育不全 降低下游 BMP2 表達(dá),導(dǎo)致 FGF4 和 FGF8 過(guò)度表達(dá)
GJA1 c.T274C; p.Y92H 腳趾:正常
IV-a SDTY4;哈斯型 7q36; ZRS (LMBR1) 186200 SHH 調(diào)控元件 (ZRS) 中的雜合變異和重復(fù) AD 有效性、雙側(cè)性,常伴有多指 改變 ZRS 控制/肢體特定的 SHH 表達(dá)
手指:所有手指均有蹼;前軸/后軸多指,杯狀手
腳趾:正常
IV-b 安德森-漢森型 n.r n.r n.r n.r 手指:所有手指均有蹼;前軸/后軸多指,杯狀手 n.r
腳趾:趾蹼多變,伴有多指畸形
V SDTY5;Dowd型 2q31; 186300 c.950A > G;p.Q317R,以及多聚丙氨酸擴(kuò)增 AD 有效的 抑制視黃酸
HOXD13 手指:4/5 手指掌骨融合;掌骨發(fā)育不全 4/5
  腳趾:中軸蹼
VI 連指手套類(lèi)型 n.r n.r n.r AD 單側(cè)的 n.r
手指:2/5 手指
腳趾: 2/5 腳趾
VII-a Cenani-Lenz 型;勺手型 11p12–p11.2; 212780 錯(cuò)義變異賊為常見(jiàn),c.1117C > T;p.R373W AR 手指:全骨性并指,掌骨融合,匙頭形狀 WNT 過(guò)表達(dá)
LRP4 腳趾:全骨性并指畸形,伴有跖骨融合 /推測(cè)會(huì)導(dǎo)致 Notch 信號(hào)抑制
VII-b 少指畸形 15q13.3; n.r GREM1和FMN1 1 基因存在 1.7 Mb 重復(fù) AD 手指:少數(shù)手指變形 BMP 拮抗劑 GREM1(通常受 FGF 抑制);在突變形式下活躍,抑制 BMP 活性
GREM1-FMN1 腳趾:趾骨多變
VIII-a Orel-Holmes type Xq21.1; FGF16 309630 外顯子 3 中的無(wú)義基因突變序列 p.R179X 和 p.S157X X-R 手指:4/5 掌骨融合 損害 FGF16-FGFR1 相互作用
腳趾:正常
VIII-b 勒奇型 n.r n.r n.r AD 手指:4/5 掌骨融合 n.r
腳趾:正常
IX MSSD;Malik-Percin 類(lèi)型 17p13.3/ 609432 c.311T > C; p.Ile104Thr AR 手指:中軸骨性并指畸形,伴有指骨退化 異位 FGF8 表達(dá)限制 BMP 抑制
BHLHA9 腳趾:前軸蹼;遠(yuǎn)端指骨發(fā)育不全

然而,關(guān)于非綜合征性并指癥分類(lèi)也存在一些爭(zhēng)議。多指并指基因解碼的收錄數(shù)據(jù)中有一例皮膚并指癥,發(fā)生在二/五指或三/五指中,而不伴有多指畸形。這種不伴有多指畸形的孤立性并指癥類(lèi)似于 III 型并指癥,后者是由GJA1基因變異引起的,已在四/五指或三/五指中觀察到。然而,盡管與 III 型相似,但作者觀察到 ch7q36.3( LMBR1區(qū)域)中存在一種變異,該變異與具有相似表型的小鼠的錘狀趾基因座同源。這可能突顯出這是一種遺傳異質(zhì)性的病例,并支持這種類(lèi)型可能是多基因的觀點(diǎn)。

另外兩份關(guān)于 IX 型并指畸形的報(bào)告以第三和第四掌骨骨性愈合為特征,由此相關(guān)的表型略有不同。佳學(xué)基因致病基因鑒定基因解碼收錄了一例涉及第二和第三近端指骨的 MSSD 病例,這與 Malik 的原始分類(lèi)不同,并將其歸因于一種新的無(wú)綜合征類(lèi)型。然而,Malik不同意這一觀點(diǎn),并將其重新歸類(lèi)為與BHLHA9基因相關(guān)的無(wú)綜合征 IX 型。另有一個(gè)基因檢測(cè)案例屬于MSSD 病例,其第二和第三掌骨近端指骨呈三角形,與 Weinrich 的病例??報(bào)告相似,此外還有尺骨半肢畸形(縮短),這是一個(gè)新發(fā)現(xiàn) 。這兩例 MSSD 病例均未進(jìn)行基因檢測(cè),分類(lèi)結(jié)論基于手部 X 光檢查。如果它映射到同一個(gè)基因,這可能是與BHLHA9基因相關(guān)的一種表型異質(zhì)性。因此,基因檢測(cè)仍然是必不可少的,以便能夠進(jìn)一步評(píng)估這些不一致之處。

 

應(yīng)用于基因篩查

有關(guān)并指畸形基因的新證據(jù)可能提供一種替代的基因篩查方法,尤其是在幾乎無(wú)法進(jìn)行放射診斷的產(chǎn)前診斷中。非綜合征性并指畸形所涉及的GJA1、HOXD13和FGF16基因涉及第四指網(wǎng),可以以產(chǎn)前篩查為借口提供診斷選擇,以防止以后出現(xiàn)成角畸形 。LMBR1 、LRP4和HOX13基因在綜合征和非綜合征形式中均被失調(diào)(圖 1)。此外,HOXD13可能能夠調(diào)節(jié)皮膚和骨質(zhì)并指通路。因此,將這些基因納入基因組將擴(kuò)大診斷標(biāo)準(zhǔn)。在診斷過(guò)程中,如果基因檢測(cè)未得出結(jié)論,則篩查側(cè)翼區(qū)域和內(nèi)含子區(qū)域可能很重要。不要忘記,在綜合征中,并指本身的存在有時(shí)可能是對(duì)綜合征進(jìn)行分類(lèi)的決定性因素(例如:SLOS 中的第二/第三腳趾并指)。

并指畸形基因檢測(cè)

 

圖1:多指并指基因解碼基因檢測(cè)分析了綜合征性和非綜合征性并指癥的基因和基因位點(diǎn)的代表性。這些變異根據(jù)其參與記錄的并指癥發(fā)病機(jī)制相互作用而進(jìn)一步表征。WNT無(wú)翅型整合位點(diǎn)家族、BMP骨形態(tài)發(fā)生蛋白、FGF 成纖維細(xì)胞生長(zhǎng)因子、RA視黃酸

 

進(jìn)一步明確并指發(fā)生的基因原因

非綜合征性并指癥被認(rèn)為具有很好的特征,但相關(guān)的 MSSD 表型存在爭(zhēng)議,兩例病例報(bào)告均未包括 BHLHA9 的基因檢測(cè),因此不能排除表型異質(zhì)性的可能性。遺傳異質(zhì)性;盡管 Cenani Lenz 表型被歸因于基因LRP4,但也有基因解碼稱(chēng)APC基因具有相同的表型。此外,Qattan 的研究中 III 型并指癥可能證明除了GLI3之外還有另一個(gè)基因座。此外,由于 BMP 是分泌因子,基因表達(dá)模式不會(huì)與功能觀點(diǎn)有效相關(guān)。因此,還需要考慮蛋白質(zhì)分布。此外,了解基因-基因相互作用、非編碼變異和表觀遺傳學(xué)有助于更好地表征并指表型。

對(duì)于第一和第四蹼狀并指畸形,建議在嬰兒 6 月齡左右時(shí)盡早分開(kāi)。因此,除了涉及這些蹼狀并指畸形的其他已知基因外,可以?xún)?yōu)先檢測(cè)與無(wú)綜合征 Castilla 型和 Lerch 型相關(guān)的基因。并指畸形的復(fù)雜性進(jìn)一步增強(qiáng),因?yàn)橐粋€(gè)基因可能涉及多條通路。已知LRP4基因基因突變序列與 WNT 的過(guò)度表達(dá)有關(guān),但也有基因突變序列顯示 Notch 信號(hào)傳導(dǎo)被破壞。另一方面,大多數(shù)綜合征并指表型在可能參與的通路方面并沒(méi)有明確下來(lái),這是因?yàn)楹芏嗷驒z測(cè)沒(méi)有采用更為先進(jìn)的基因解碼技術(shù)。

孟德?tīng)栃誀詈腿蚪M關(guān)聯(lián)研究(GWAS)的治療靶點(diǎn)更有可能在多因素疾病的臨床研究中取得成功。因此,在這方面進(jìn)行基因檢測(cè)分析對(duì)于醫(yī)生和患者來(lái)說(shuō)都有明確的治療價(jià)值。

 

并指基因檢測(cè)的共識(shí)性意見(jiàn)

手足的自然發(fā)育是一個(gè)受到嚴(yán)格調(diào)控的過(guò)程,涉及大量基因。傳統(tǒng)觀點(diǎn)認(rèn)為,WNT 經(jīng)典通路導(dǎo)致趾間細(xì)胞死亡,從而導(dǎo)致并指畸形。然而,許多信號(hào)傳導(dǎo)通路還未明確的基因也參與了這一疾病過(guò)程的發(fā)生,大多數(shù)其他通路僅在動(dòng)物研究中進(jìn)行研究。并指發(fā)生的致病基因鑒定基因解碼認(rèn)為,經(jīng)典和非經(jīng)典 WNT 信號(hào)、Notch 信號(hào)、ADAMTS 金屬蛋白酶通路和非編碼區(qū)域中的基因聚集可能協(xié)同作用,以建立正常的肢芽發(fā)育。對(duì)HOXD13、LMBR1、FGF16、BHLHA9進(jìn)行候選基因研究,以了解它們對(duì)皮膚和骨性并指畸形表型的貢獻(xiàn),可以增強(qiáng)篩查。由于迫切需要進(jìn)行產(chǎn)前基因檢測(cè),因此GJA1、HOXD13和FGF16基因以及涉及第一和第四個(gè)蹼的其他基因也可能被優(yōu)先考慮??偟膩?lái)說(shuō),將這些發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)化為人類(lèi)研究,尤其是通路圖譜,可以進(jìn)一步解決與并指畸形相關(guān)的遺傳基礎(chǔ)。此外,它將有助于治療并指畸形并促進(jìn)生物標(biāo)志物的發(fā)現(xiàn)。


(責(zé)任編輯:佳學(xué)基因)
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