【佳學(xué)基因檢測】高通量基因測序(HTS_NGS)基因檢測中實驗室工作的重要性
目前,圍繞高通量基因測序(HTS-NGS)的大多數(shù)主要文獻(xiàn)、綜術(shù)和觀念的介紹往往側(cè)重于該技術(shù)的應(yīng)用、平臺評估和數(shù)據(jù)分析的生物信息學(xué)方法。雖然這三個方面在生成高保真數(shù)據(jù)方面都極為重要,但過分關(guān)注這些方面并不能解決實驗方案、實驗室工作的具體操作步驟的嚴(yán)格要求。佳學(xué)基因根據(jù)對不同檢測機(jī)構(gòu)產(chǎn)生錯誤基因檢測報告的來源進(jìn)行分析后提醒基因檢測實驗室建設(shè)機(jī)構(gòu),人們處理的數(shù)據(jù)在現(xiàn)在和未來都應(yīng)當(dāng)通過嚴(yán)格的實驗操作步驟來高效實驗數(shù)據(jù)獲取的質(zhì)量。高端生物信息學(xué)無法彌補樣品制備不良對產(chǎn)品造成的損害、人工制品的摻入或污染。因此,除了用于生成擴(kuò)增子測序文庫的方法外,還必須仔細(xì)考慮用于測序的樣本質(zhì)量控制方法。這些方面與仔細(xì)選擇針對所選基質(zhì)優(yōu)化的提取方法的同等重要需求無關(guān)。雖然DNA分離方法是一個關(guān)鍵考慮因素。雖然佳學(xué)基因?qū)ζ渲械拿恳粋€方面都有標(biāo)準(zhǔn)和質(zhì)量要求,但是如何在DNA提取后,更好地處理擴(kuò)增子工作流程,以生成特定DNA區(qū)域的與真實情況的數(shù)據(jù)是佳學(xué)基因特意強(qiáng)調(diào)的部分。
通過一系列簡單實驗,佳學(xué)基因強(qiáng)調(diào)了準(zhǔn)備開始使用擴(kuò)增子測序時應(yīng)考慮的各個方面,其中一些方面同樣適用于鳥槍測序。這些實驗主要集中在典型的擴(kuò)增子測序工作流程中的三個實驗設(shè)計或者是操作領(lǐng)域:樣本篩選、目標(biāo)區(qū)域和文庫生成以及這些步驟對數(shù)據(jù)分析的影響。佳學(xué)基因指出在進(jìn)行擴(kuò)增子測序時,需要在試驗臺上更加注意。根據(jù)佳學(xué)基因的研究結(jié)查,也可以給出一套靈活適用的操作指南,例如用于qPCR數(shù)據(jù)的MIQE指南,用于規(guī)范化擴(kuò)增子測的的數(shù)據(jù)生成和分析。
而對于不是這一領(lǐng)域的工作人員的讀者來說,明白全外顯子測序、全基因測序不是檢測的報告的全部決定因素。
(責(zé)任編輯:佳學(xué)基因)