【佳學(xué)基因檢測】肺癌組織基因檢測揭示的基因突變演變過程
佳學(xué)基因?qū)Ψ伟┗驒z測的介紹：
肺癌是全球癌癥相關(guān)死亡的主要原因。佳學(xué)基因檢測分析了前421例納入TRACERx研究的非小細胞肺癌患者手術(shù)或隨訪期間采集的1,644個腫瘤區(qū)域。該項目旨在解碼肺癌演化,并解決主要研究終點:確定腫瘤內(nèi)異質(zhì)性與臨床預(yù)后之間的關(guān)系。在肺腺癌中,40種常見癌癥基因中有22種受到顯著的亞克隆選擇作用,包括經(jīng)典的腫瘤發(fā)生基因,如TP53和KRAS。肺癌致病基因鑒定基因解碼確定了驅(qū)動因子、突變過程和全基因組加倍(WGD)事件之間的進化依賴關(guān)系。盡管患者有吸煙史,但8%的肺腺癌沒有煙草誘導(dǎo)的突變證據(jù)。與從未吸煙者的腫瘤相比,這些腫瘤的EGFR突變和RET、ROS1、ALK和MET致癌異構(gòu)體的檢出率相似,這表明它們可能具有相似的病因和發(fā)病過程。大規(guī)模亞克隆擴增與正向亞克隆選擇相關(guān)。harbour賊近亞克隆擴增(在系統(tǒng)發(fā)育樹分支的末端)的患者無病生存期顯著縮短。19%的腫瘤檢測到亞克隆WGD,10%的腫瘤并存有多個平行的亞克隆WGD。亞克隆WGD(而不是主克隆WGD)與無病生存期縮短相關(guān)?？截悢?shù)異質(zhì)性與術(shù)后1年內(nèi)胸外反復(fù)相關(guān)。這些數(shù)據(jù)證明了克隆擴增、WGD和拷貝數(shù)不穩(wěn)定性在確定非小細胞肺癌反復(fù)時間和模式中的重要性,并提供了一個全面的臨床癌癥進化數(shù)據(jù)資源。
肺癌基因檢測關(guān)鍵詞：
轉(zhuǎn)化研究,遺傳學(xué)研究
肺癌發(fā)生與惡化的基因檢測分析
肺癌是全球癌癥相關(guān)死亡的主要原因,占癌癥相關(guān)死亡率的18%和癌癥發(fā)病率的11%。然而,導(dǎo)致這種aggressive腫瘤行為的生物學(xué)機制仍然很大程度上未被闡明。多區(qū)域測序提供了一個利用觀察到的腫瘤內(nèi)異質(zhì)性(ITH)來推斷腫瘤系統(tǒng)發(fā)育的機會。然而,其他基因檢測使用原發(fā)腫瘤樣本的多區(qū)域測序(在此稱為"區(qū)域")的研究,對于給定的腫瘤類型,樣本數(shù)量僅限于100例或更少,這限制了基因組和臨床分析的統(tǒng)計力。腫瘤內(nèi)異質(zhì)性(ITH)的功能相關(guān)性也一直存在爭議,對于個性化醫(yī)學(xué)有重要影響。
非小細胞肺癌(NSCLC)通過治療的進化跟蹤(TRACERx)(臨床試驗.gov識別號:NCT01888601)是一項前瞻性多中心癌癥研究,旨在從診斷和手術(shù)切除到治好或疾病反復(fù),勾勒出腫瘤演化過程。TRACERx的兩個主要終點是確定腫瘤內(nèi)異質(zhì)性(ITH)與臨床結(jié)果之間的關(guān)聯(lián),以及鉑類輔助化療對反復(fù)疾病中腫瘤內(nèi)異質(zhì)性(ITH)的影響。2017年,對前100例納入TRACERx的患者的分析揭示了普遍存在的基因組腫瘤內(nèi)異質(zhì)性(ITH),以及體細胞拷貝數(shù)變化(SCNA)異質(zhì)性與預(yù)后不良之間存在顯著關(guān)聯(lián)。然而,并未觀察到突變腫瘤內(nèi)異質(zhì)性(ITH)與預(yù)后之間的關(guān)系。在這個項目中,佳學(xué)基因擴展了對NSCLC進化基礎(chǔ)的理解,并進一步研究了已建立和新的腫瘤內(nèi)異質(zhì)性(ITH)測量指標與臨床結(jié)果之間的關(guān)系。為此,佳學(xué)基因利用前421例前瞻性納入TRACERx的患者的多區(qū)域外顯子組原發(fā)腫瘤數(shù)據(jù)。
